通常将小米放在阴凉、干燥、通风较好的地方。储藏前水分过大时，不能曝晒，可阴干。储藏前应去除糠杂。藏后若发现吸湿脱糠、发热时，要及时出风过筛，除糠降温，以防霉变。小米易遭蛾类幼虫等危害，发现后可将上部生虫部分排出单独处理。在容器内放1袋新花椒即可防虫。
优质的有机小米米粒大小和颜色均匀，呈乳白色、黄色或金黄色，有光泽，很少有碎米，无虫，无杂质。闻起来具有正常的清香味，无其他异味，手摸有凉爽感，放在嘴里咀嚼有微甜的感觉，无任何异味。
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