1、防止混放。化肥混放在一起，容易使物理性状变差。如过磷酸钙遇到硝酸铵，会增加吸湿性，造成施用不便。
2、标志名不副实。有的农户使用复混肥袋装尿素，有的用尿素袋装复混肥或硫酸铵，还有的用进口复合肥袋装专用肥，这样在使用过程中很容易出现差错。
3、防破袋包装。如硝态氮飞料吸湿性强，吸水后会化为浆状物，甚至呈液体，应密封贮存，一般用缸或坛等陶瓷容器存放，严密加盖。
4、防火。特别是硝酸铵、硝酸钾等硝态氮肥，遇高温会分解出氧，遇明火就会发生燃烧或爆炸。
5、防腐蚀。过磷酸钙中有游离酸，碳酸氢铵则呈碱性，这类化肥不要与金属容器或磅秤等接触，以免受到腐蚀。
6、芳肥料与种子、食物混存。特别是挥发性强的碳酸氢铵、氨水余种子混放会影响发芽，应予以充分注意。